两者有以下不同：适应病毒类型、适用群体、先后顺序不同。

1、适应病毒类型

医学隔离一般是甲等流行传染病。

医学观察主要用于乙类传染病。

2、适用群体不同

医学隔离对疑似病例完全与外界隔离，只有专职的医务人员消毒后方可入内，做好院内感染控制和医务人员的个人防护工作。

医学观察采取医学观察措施的人并不仅仅是疑似病人，还应包括可疑病人和密切接触者。（密切观察，但不限制活动）

3、先后顺序不同

对医学观察期间出现发热或呼吸道症状者，在采取有效防护条件下，应立即送定点医疗机构进行医学隔离治疗。所以医学观察是医学隔离的前序作业。

医学观察的前序作业有很多，比如医学检查、自我隔离等等。

参考资料来源：百度百科—医学隔离

参考资料来源：百度百科—医学观察